MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56

Total Repeats: 22133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007899	TTC	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897808
2	NC_007899	AGA	2	6	253	258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897808
3	NC_007899	AAAC	2	8	286	293	75 %	0 %	0 %	25 %	89897808
4	NC_007899	GAA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897808
5	NC_007899	AGG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89897808
6	NC_007899	CTT	2	6	416	421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897808
7	NC_007899	GCT	2	6	462	467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89897808
8	NC_007899	AGA	2	6	477	482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897808
9	NC_007899	GAT	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897808
10	NC_007899	GCA	2	6	561	566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89897808
11	NC_007899	TCT	2	6	612	617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897808
12	NC_007899	TAC	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897808
13	NC_007899	TCT	2	6	860	865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897808
14	NC_007899	GCA	2	6	870	875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89897808
15	NC_007899	T	6	6	894	899	0 %	100 %	0 %	0 %	89897808
16	NC_007899	GA	3	6	973	978	50 %	0 %	50 %	0 %	89897808
17	NC_007899	CTT	2	6	1009	1014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897808
18	NC_007899	CAT	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897808
19	NC_007899	CAT	2	6	1044	1049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897808
20	NC_007899	AG	3	6	1080	1085	50 %	0 %	50 %	0 %	89897808
21	NC_007899	CTC	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89897808
22	NC_007899	AAAC	2	8	1134	1141	75 %	0 %	0 %	25 %	89897808
23	NC_007899	TGC	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89897808
24	NC_007899	CGT	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89897808
25	NC_007899	CAC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89897808
26	NC_007899	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897808
27	NC_007899	GAG	2	6	1518	1523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89897808
28	NC_007899	GAA	2	6	1554	1559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897808
29	NC_007899	T	6	6	1734	1739	0 %	100 %	0 %	0 %	89897808
30	NC_007899	ATT	2	6	1750	1755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897808
31	NC_007899	AAC	2	6	1908	1913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89897809
32	NC_007899	GA	3	6	1978	1983	50 %	0 %	50 %	0 %	89897809
33	NC_007899	AGG	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89897809
34	NC_007899	CTT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897809
35	NC_007899	TAT	2	6	2063	2068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897809
36	NC_007899	T	6	6	2249	2254	0 %	100 %	0 %	0 %	89897810
37	NC_007899	AAT	2	6	2255	2260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897810
38	NC_007899	AT	3	6	2272	2277	50 %	50 %	0 %	0 %	89897810
39	NC_007899	GAA	2	6	2299	2304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897810
40	NC_007899	GTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89897810
41	NC_007899	TAA	2	6	2334	2339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897810
42	NC_007899	TATC	2	8	2351	2358	25 %	50 %	0 %	25 %	89897810
43	NC_007899	ATC	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897810
44	NC_007899	AGA	2	6	2470	2475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897810
45	NC_007899	CAC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89897810
46	NC_007899	T	7	7	2576	2582	0 %	100 %	0 %	0 %	89897810
47	NC_007899	TGA	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897810
48	NC_007899	C	6	6	2643	2648	0 %	0 %	0 %	100 %	89897810
49	NC_007899	T	6	6	2745	2750	0 %	100 %	0 %	0 %	89897810
50	NC_007899	TCA	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897810
51	NC_007899	TCG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89897810
52	NC_007899	ATC	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897810
53	NC_007899	GTAT	2	8	2905	2912	25 %	50 %	25 %	0 %	89897810
54	NC_007899	ACC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89897810
55	NC_007899	TCT	2	6	3064	3069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897810
56	NC_007899	ATC	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897810
57	NC_007899	AT	3	6	3116	3121	50 %	50 %	0 %	0 %	89897810
58	NC_007899	TTG	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89897811
59	NC_007899	T	6	6	3235	3240	0 %	100 %	0 %	0 %	89897811
60	NC_007899	TACCT	2	10	3277	3286	20 %	40 %	0 %	40 %	89897811
61	NC_007899	ATG	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897811
62	NC_007899	T	6	6	3431	3436	0 %	100 %	0 %	0 %	89897811
63	NC_007899	CAA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89897811
64	NC_007899	T	6	6	3599	3604	0 %	100 %	0 %	0 %	89897811
65	NC_007899	A	6	6	3605	3610	100 %	0 %	0 %	0 %	89897811
66	NC_007899	T	6	6	3661	3666	0 %	100 %	0 %	0 %	89897811
67	NC_007899	TAA	2	6	3708	3713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897811
68	NC_007899	GTT	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89897812
69	NC_007899	AAAT	2	8	3899	3906	75 %	25 %	0 %	0 %	89897812
70	NC_007899	CAC	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89897812
71	NC_007899	T	7	7	3953	3959	0 %	100 %	0 %	0 %	89897812
72	NC_007899	AAG	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897812
73	NC_007899	CAAG	2	8	4027	4034	50 %	0 %	25 %	25 %	89897812
74	NC_007899	T	7	7	4073	4079	0 %	100 %	0 %	0 %	89897812
75	NC_007899	ATG	3	9	4199	4207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897812
76	NC_007899	ATT	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897812
77	NC_007899	CTT	2	6	4306	4311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897812
78	NC_007899	ATA	2	6	4324	4329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897812
79	NC_007899	TTA	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897812
80	NC_007899	GAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897812
81	NC_007899	AT	3	6	4489	4494	50 %	50 %	0 %	0 %	89897812
82	NC_007899	TCT	2	6	4500	4505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897812
83	NC_007899	ATA	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897812
84	NC_007899	TA	3	6	4746	4751	50 %	50 %	0 %	0 %	89897813
85	NC_007899	T	6	6	4764	4769	0 %	100 %	0 %	0 %	89897813
86	NC_007899	GAG	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89897813
87	NC_007899	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897813
88	NC_007899	TCT	2	6	4937	4942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897813
89	NC_007899	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897813
90	NC_007899	AGTC	2	8	4983	4990	25 %	25 %	25 %	25 %	89897813
91	NC_007899	T	6	6	4999	5004	0 %	100 %	0 %	0 %	89897813
92	NC_007899	ATG	2	6	5014	5019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897813
93	NC_007899	AGA	2	6	5048	5053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897813
94	NC_007899	CGG	2	6	5060	5065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89897813
95	NC_007899	ATA	2	6	5092	5097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897813
96	NC_007899	TTTG	2	8	5162	5169	0 %	75 %	25 %	0 %	89897813
97	NC_007899	TTG	2	6	5262	5267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89897813
98	NC_007899	CAA	2	6	5280	5285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89897813
99	NC_007899	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897813
100	NC_007899	CA	3	6	5320	5325	50 %	0 %	0 %	50 %	89897813
101	NC_007899	GAAG	2	8	5352	5359	50 %	0 %	50 %	0 %	89897813
102	NC_007899	ATT	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897813
103	NC_007899	TTA	2	6	5388	5393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897813
104	NC_007899	AG	4	8	5397	5404	50 %	0 %	50 %	0 %	89897813
105	NC_007899	CAG	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89897813
106	NC_007899	ATT	2	6	5503	5508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897813
107	NC_007899	GAT	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897813
108	NC_007899	AAG	2	6	5529	5534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897813
109	NC_007899	TAA	2	6	5716	5721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89897813
110	NC_007899	A	7	7	5796	5802	100 %	0 %	0 %	0 %	89897813
111	NC_007899	AAAC	2	8	5868	5875	75 %	0 %	0 %	25 %	89897813
112	NC_007899	ATT	2	6	5928	5933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897813
113	NC_007899	CT	3	6	5942	5947	0 %	50 %	0 %	50 %	89897813
114	NC_007899	TGA	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897813
115	NC_007899	ACA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89897813
116	NC_007899	ATG	2	6	6028	6033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897813
117	NC_007899	TAGA	2	8	6034	6041	50 %	25 %	25 %	0 %	89897813
118	NC_007899	ATG	2	6	6060	6065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897813
119	NC_007899	TGA	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89897813
120	NC_007899	TTAT	2	8	6180	6187	25 %	75 %	0 %	0 %	89897813
121	NC_007899	AGA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897813
122	NC_007899	TCA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89897813
123	NC_007899	GAA	3	9	6291	6299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897813
124	NC_007899	CGT	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89897813
125	NC_007899	TTA	2	6	6414	6419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897813
126	NC_007899	AAAT	2	8	6437	6444	75 %	25 %	0 %	0 %	89897813
127	NC_007899	AAG	2	6	6451	6456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89897813
128	NC_007899	ATT	2	6	6463	6468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89897813
129	NC_007899	GT	3	6	6493	6498	0 %	50 %	50 %	0 %	89897813
130	NC_007899	AG	3	6	6573	6578	50 %	0 %	50 %	0 %	89897813
131	NC_007899	CTT	2	6	6628	6633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897814
132	NC_007899	TGT	2	6	6639	6644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89897814
133	NC_007899	ACA	2	6	6648	6653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89897814
134	NC_007899	A	7	7	6708	6714	100 %	0 %	0 %	0 %	89897814
135	NC_007899	TCT	2	6	6736	6741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897814
136	NC_007899	T	6	6	6824	6829	0 %	100 %	0 %	0 %	89897814
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138	NC_007899	CTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89897814
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